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Chordopoxvirinae ( الألمانية )

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Die Unterfamilie Chordopoxvirinae fasst acht Gattungen der Familie Poxviridae zusammen, die bei Wirbeltieren (Vertebraten), beispielsweise Säugetieren, Vögeln und Nagetieren, Infektionen verursachen können. Die Unterfamilie wurde geschaffen, um diese Gattungen von den Mitgliedern der Unterfamilie Entomopoxvirinae zu separieren, die nur Pockenviren bei Insekten umfassen. Aufgrund dieser Abtrennung wurde der Name der Gattung nicht nach den Wirbeltieren „Vertebropoxvirinae“ benannt, sondern nach dem Stamm der Chordatiere, obwohl noch keine Pockenviren bei nicht zu den Wirbeltieren gehörenden Chordatieren isoliert wurden. Diese Einteilung nach dem Wirtsspektrum spiegelt sich auch in der phylogenetischen Distanz zwischen Chordo- und Entomopoxvirinae wider.

Zwischen den Gattungen der Chordopoxvirinae wird eine serologische Kreuzreaktivität beobachtet, wobei die Mitglieder der Avipoxviren bei Vögeln diese Eigenschaft weniger aufweisen als die Viren bei Säugetieren. Einige Mitglieder der Chordopoxvirinae verursachen typische Läsionen auf der Chorioallantoismembran, wenn sie in embryonierten Hühnereiern für Laborzwecke angezüchtet werden.

Aufbau und Genom

Die Mitglieder der Chordopoxvirinae stellen sich als ovoide oder Backstein-förmige Virionen dar.

Das lineare, doppelsträngige DNA-Genom besitzt gewöhnlich einen niedrigen GC-Gehalt von 30 bis 40 %, kann aber von 25 bis 67 % variieren. Ein hoher GC-Gehalt liegt bei den Gattungen Parapoxvirus und Crocodylidpoxvirus sowie dem Molluscum-contagiosum-Virus vor.[2][3][4]

Das Genom von Molluscum contagiosum virus Subtyp 1 hat einen GC-Gehalt von 63,4 %, das der Parapoxviren Bovine papular stomatitis virus (Strain BV-AR02) und Orf virus (Strain OV-SA00) hat 64,5 % respektive 64,3 %.[4] Das Genom des Nile crocodilepox virus hat eine Länge von 190.054 Basenpaaren (bp). Es kodiert vorhergesagt für 173 Proteine bei einem GC-Gehalt von 61,9 % (Strain Simbabwe).[5][4]

Eine stets gleichförmig angeordnete Gruppe von zentralen Genen charakterisiert die Chordopoxvirinae trotz variabler Sequenzen zwischen den Gattungen.

Systematik

Die innere Systematik der Chordopoxvirinae ist nach ICTV, Stand November 2018, wie folgt:[6]

  • Unterfamilie Chordopoxvirinae

Für eine ausführliche Darstellung siehe Poxviridae.

Quellen

  • R. M. Buller et al.: Subfamily Chordavirinae. In: C. M. Fauquet, M. A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London, San Diego, 2005, S. 122 ISBN 0-12-249951-4
  • B. Moss: Poxviridae: The Viruses and Their Replication. In: David M. Knipe, Peter M. Howley (eds.-in-chief): Fields’ Virology. 5. Auflage, Band 2, Philadelphia 2007, S. 2906ff ISBN 0-7817-6060-7

Einzelnachweise

  1. a b c d e ICTV: ICTV Taxonomy history: Variola virus, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  2. Eneida L. Hatcher, Chunlin Wang, Elliot J. Lefkowitz: Genome Variability and Gene Content in Chordopoxviruses: Dependence on Microsatellites, in: Viruses 7(4), 2015, S. 2126–2146, doi:10.3390/v7042126
  3. S. Roychoudhury, A. Pan, D. Mukherjee: Genus specific evolution of codon usage and nucleotide compositional traits of poxviruses. In: Virus Genes. 42, Nr. 2, 2011, S. 189–199. doi:10.1007/s11262-010-0568-2. PMID 21369827.
  4. a b c Yu Li, Hermann Meyer, Hui Zhao, Inger K. Damon: GC Content-Based Pan-Pox Universal PCR Assays for Poxvirus Detection, in: J Clin Microbiol. 48(1, Januar 2010, S. 268–276, online 11. November 2009, doi:10.1128/JCM.01697-09. PMC 2812294 (freier Volltext).
  5. David M. Needham, Alexandra Z. Worden et al.: A distinct lineage of giant viruses brings a rhodopsin photosystem to unicellular marine predators, in: PNAS, 23. September 2019, doi:10.1073/pnas.1907517116, ISSN 0027-8424, hier: Supplement 1 (xlsx)
  6. ICTV: Master Species List 2018a v1, MSL including all taxa updates since the 2017 release. Fall 2018 (MSL #33)
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Chordopoxvirinae: Brief Summary ( الألمانية )

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Die Unterfamilie Chordopoxvirinae fasst acht Gattungen der Familie Poxviridae zusammen, die bei Wirbeltieren (Vertebraten), beispielsweise Säugetieren, Vögeln und Nagetieren, Infektionen verursachen können. Die Unterfamilie wurde geschaffen, um diese Gattungen von den Mitgliedern der Unterfamilie Entomopoxvirinae zu separieren, die nur Pockenviren bei Insekten umfassen. Aufgrund dieser Abtrennung wurde der Name der Gattung nicht nach den Wirbeltieren „Vertebropoxvirinae“ benannt, sondern nach dem Stamm der Chordatiere, obwohl noch keine Pockenviren bei nicht zu den Wirbeltieren gehörenden Chordatieren isoliert wurden. Diese Einteilung nach dem Wirtsspektrum spiegelt sich auch in der phylogenetischen Distanz zwischen Chordo- und Entomopoxvirinae wider.

Zwischen den Gattungen der Chordopoxvirinae wird eine serologische Kreuzreaktivität beobachtet, wobei die Mitglieder der Avipoxviren bei Vögeln diese Eigenschaft weniger aufweisen als die Viren bei Säugetieren. Einige Mitglieder der Chordopoxvirinae verursachen typische Läsionen auf der Chorioallantoismembran, wenn sie in embryonierten Hühnereiern für Laborzwecke angezüchtet werden.

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Chordopoxvirinae ( الإنجليزية )

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Chordopoxvirinae is a subfamily of viruses in the family Poxviridae. Vertebrates and arthropods serve as natural hosts. Currently, 52 species are placed in this subfamily, divided among 18 genera. Diseases associated with this subfamily include smallpox.[1][2]

Four genera in this subfamily contain species that infect humans: Molluscipoxvirus, Orthopoxvirus, Parapoxvirus, and Yatapoxvirus.

Virology

The virions are generally enveloped though the intracellular mature virion form of the virus, which contains a different envelope, and is also infectious. They vary in their shape depending upon the species, but are generally shaped like a brick or as an oval form similar to a rounded brick because they are wrapped by the endoplasmic reticulum. The virion is exceptionally large, around 200 nm in diameter and 300 nm in length, and carries its genome in a single, double-stranded segment of DNA.[3] Genomes are linear, around 130-375kb in length.[1]

Lifecycle

Viral replication is cytoplasmic. Entry into the host cell is achieved by attachment of the viral proteins to host glycosaminoglycans (GAGs), which mediate endocytosis of the virus into the host cell. Fusion with the plasma membrane releases the core into the host cytoplasm. In the early phase, early genes are transcribed in the cytoplasm by viral RNA polymerase. Early expression begins at 30 minutes postinfection. The core is completely uncoated as early expression ends, the viral genome is then free in the cytoplasm. In the intermediate phase, intermediate genes are expressed, triggering genomic DNA replication about 100 minutes after infection. In the late phase, late genes are expressed from 140 min to 48 hours postinfection, producing all structural proteins. Assembly of progeny virions starts in cytoplasmic viral factories, producing a spherical, immature particle. This virus particle matures into brick-shaped intracellular mature virion, which can be released upon cell lysis, or can acquire a second double membrane from trans-Golgi and bud as external enveloped virion host receptors, which mediates endocytosis. Replication follows the DNA strand displacement model. DNA-templated transcription is the method of transcription. The virus exits the host cell by microtubular outwards viral transport, and exists in occlusion bodies after cell death and remains infectious until finding another host. Humans, vertebrates, and arthropods serve as the natural host. Transmission routes are fomite, contact, and airborne particles.[1]

Taxonomy

The classification in this subfamily is based on the morphology, nucleic acid type, mode of replication, host organisms, and type of disease caused.

Nine genera in this subfamily are recognized; also, a number of species have not yet been assigned to a genus.

The species in the genus Avipoxvirus infect birds; those in the genera Caiman poxvirus and Crocodylipoxvirus both infect crocodilians.

The other genera in this subfamily infect mammals.

The following genera are recognized:[2]

Evolution

The last common ancestor of the extant poxviruses that infect vertebrates existed 0.5 million years ago. The genus Avipoxvirus diverged from the ancestor 249 ± 69 thousand years ago. The ancestor of the genus Orthopoxvirus was next to diverge from the other clades at 0.3 million years ago. A second estimate of this divergence time places this event at 166 ± 43,000 years ago.[4] The division of the Orthopox into the extant species occurred about 14,000 years ago. The genus Leporipoxvirus diverged around 137 ± 35,000 years ago. This was followed by the ancestor of the genus Yatapoxvirus. The last common ancestor of the Capripoxvirus and Suipoxvirus diverged 111 ± 29,000 years ago.

A Bayesian study of orthopox genomes suggests that the unclassified Yoka poxvirus diverged from the lineage that gave rise to the orthopoxviruses roughly 90,000 years ago.[5] The orthopox viruses diverged from the other pox viruses about 10,000 years ago. Camelpox, taterapox, and variola viruses arose 3,500 years ago and horsepox virus 3,000 years ago. These viruses may have arisen in the Horn of Africa.

Another Bayesian study suggests that variola arose about 3500 years ago.[6]

References

  1. ^ a b c "Viral Zone". ExPASy. Retrieved 15 June 2015.
  2. ^ a b "Virus Taxonomy: 2019 Release". talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses. Retrieved 9 May 2020.
  3. ^ International Committee on Taxonomy of Viruses (15 June 2004). "ICTVdb Descriptions: 58. Poxviridae". Archived from the original on 3 July 2007. Retrieved 26 February 2005.
  4. ^ Babkin IV, Babkina IN (2011) Molecular dating in the evolution of vertebrate poxviruses. Intervirology 54(5):253-260. doi:10.1159/000320964.
  5. ^ Babkin IV, Babkina IN (2012) A retrospective study of the orthopoxvirus molecular evolution. Infect Genet Evol
  6. ^ Babkin IV, Shelkunov SN (2008) Molecular evolution of poxviruses. Genetika 44(8):1029-1044

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Chordopoxvirinae: Brief Summary ( الإنجليزية )

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Chordopoxvirinae is a subfamily of viruses in the family Poxviridae. Vertebrates and arthropods serve as natural hosts. Currently, 52 species are placed in this subfamily, divided among 18 genera. Diseases associated with this subfamily include smallpox.

Four genera in this subfamily contain species that infect humans: Molluscipoxvirus, Orthopoxvirus, Parapoxvirus, and Yatapoxvirus.

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Chordopoxvirinae ( الإسبانية، القشتالية )

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Los Chordopoxvirinae son una subfamilia de virus perteneciente a la familia Poxviridae. Sus huéspedes en la naturaleza son los animales, donde se incluyen los humanos.[2]​ Se incluyen cuarenta especies repartidas entre once géneros a día de hoy. Las especies de esta subfamilia causan enfermedades como la viruela o el molusco contagioso.[3][4]

Virología

Los viriones presentan envoltura vírica y tienen forma ovoide o de bloque. Existen dos formas infecciosas: el virus intracelular maduro y el virus extracelular envuelto.[3]

Ciclo replicativo

La replicación ocurre en el citoplasma. Para ello, el virión se adhiere a los glucosaminoglucanos de la célula huésped y accede a su interior mediante endocitosis. La fusión de la envoltura del virus con la de la vesícula endocítica produce la liberación del nucleoide al citoplasma. La ARN polimerasa viral transcribe ciertos genes virales al poco tiempo de comenzar la infección. Posteriormente, comienza la replicación del ADN viral. En la última fase, se expresan los genes relacionados con la síntesis de las proteínas estructurales del virus. Los viriones ensamblados son formas intracelulares maduras que pueden liberarse al exterior con la lisis celular o pueden adquirir una segunda membrana procedente de las membranas del huésped, generalmente de la zona trans-Golgi del aparato de Golgi.[3]

Referencias

  1. «Chordopoxvirinae». Taxonomy (en inglés). NCBI. Consultado el 29 de enero de 2020.
  2. «Minutes of the 4th meeting of the I.C.T.V.» (en inglés). ICTV. 30 de agosto de 1978. Consultado el 29 de enero de 2020.
  3. a b c «Viral Zone» (en inglés). ExPASy. Consultado el 29 de enero de 2020.
  4. ICTV. «Virus Taxonomy: 2014 Release» (en inglés). Consultado el 29 de enero de 2020.

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Chordopoxvirinae: Brief Summary ( الإسبانية، القشتالية )

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Los Chordopoxvirinae son una subfamilia de virus perteneciente a la familia Poxviridae. Sus huéspedes en la naturaleza son los animales, donde se incluyen los humanos.​ Se incluyen cuarenta especies repartidas entre once géneros a día de hoy. Las especies de esta subfamilia causan enfermedades como la viruela o el molusco contagioso.​​

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Chordopoxvirinae ( الإيطالية )

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Chordopoxvirinae è un sottofamiglia dei Poxviridae caratterizzata dal fatto di poter infettare i vertebrati, a differenza della sottofamiglia entomopoxvirinae che infettano gli invertebrati.

La sottofamiglia include 18 generi:[1]

Note

  1. ^ Virus Taxonomy: 2019 Release, su talk.ictvonline.org, International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), luglio 2019. URL consultato il 13 giugno 2020.
  2. ^ a b Murray, pp. 514, 2007.

Bibliografia

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Chordopoxvirinae: Brief Summary ( الإيطالية )

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Chordopoxvirinae è un sottofamiglia dei Poxviridae caratterizzata dal fatto di poter infettare i vertebrati, a differenza della sottofamiglia entomopoxvirinae che infettano gli invertebrati.

La sottofamiglia include 18 generi:

Avipoxvirus Capripoxvirus Centapoxvirus Cervidpoxvirus Crocodylidpoxvirus Leporipoxvirus Macropopoxvirus Molluscipoxvirus che comprende il virus del mollusco contagioso Mustelpoxvirus Orthopoxvirus che comprende il Variola virus responsabile del vaiolo e il Vaccinia virus utilizzato per la realizzazione del vaccino antivaioloso Oryzopoxvirus Parapoxvirus Pteropopoxvirus Salmonpoxvirus Sciuripoxvirus Suipoxvirus Vespertilionpoxvirus Yatapoxvirus
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