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Thomomys bottae planirostris Burt 1931
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Thomomys bottae albatus Grinnell 1912
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Thomomys bottae anitae J. A. Allen 1898
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Thomomys bottae connectens Hall 1936
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Thomomys bottae bottae (Eydoux & Gervais 1836)
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Thomomys bottae desertorum Merriam 1901
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Thomomys bottae actuosus Kelson 1951
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Thomomys bottae birdseyei Goldman 1937
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Thomomys bottae cultellus Kelson 1951
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Thomomys bottae internatus Goldman 1936
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Thomomys bottae howelli Goldman 1936
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Thomomys bottae opulentus Goldman 1935
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Thomomys bottae pinalensis Goldman 1938
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Thomomys bottae pervarius Goldman 1938
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Thomomys bottae levidensis Goldman 1942
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Thomomys bottae optabilis Goldman 1936
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Thomomys bottae abbotti Huey 1928
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Thomomys bottae alpinus Merriam 1897
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Thomomys bottae albicaudatus Hall 1930
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Thomomys bottae alexandrae Goldman 1933
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Thomomys bottae analogus Goldman 1938
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Thomomys bottae awahnee Merriam 1908
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Thomomys bottae aphrastus Elliot 1903
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Thomomys bottae aureiventris Hall 1930
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Thomomys bottae canus Bailey 1910
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Thomomys bottae centralis Hall 1930
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Thomomys bottae catavinensis Huey 1931
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Thomomys bottae brevidens Hall 1932
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Thomomys bottae chrysonotus Grinnell 1912
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Thomomys bottae cinereus Hall 1932
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Thomomys bottae depressus Hall 1932
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Thomomys bottae contractus Durrant 1946
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Thomomys bottae collis Hooper 1940
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Thomomys bottae laticeps Baird 1855
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Thomomys bottae lacrymalis Hall 1932
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Thomomys bottae juarezensis Huey 1945
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Thomomys bottae fumosus Hall 1932
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Thomomys bottae lenis Goldman 1942
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Thomomys bottae leucodon Merriam 1897
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Thomomys bottae lucidus Hall 1932
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Thomomys bottae limitaris Goldman 1936
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Thomomys bottae modicus Goldman 1931
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Thomomys bottae mewa Merriam 1908
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Thomomys bottae nigricans Rhoads 1895
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Thomomys bottae navus Merriam 1901
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Thomomys bottae operarius Merriam 1897
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Thomomys bottae nanus Hall 1932
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Thomomys bottae morulus Hooper 1940
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Thomomys bottae pascalis Merriam 1901
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Thomomys bottae osgoodi Goldman 1931
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