dcsimg

Chlorobia ( Spanish; Castilian )

provided by wikipedia ES
Symbol question.svg
Bacterias verdes del azufre Green d winogradsky.jpgTaxonomíaDominio: BacteriaFilo: ChlorobiClase: Chlorobia o ChlorobeaOrden: ChlorobialesFamilia: ChlorobiaceaeGéneros

Las bacterias verdes del azufre o Chlorobia constituyen un pequeño grupo de bacterias del filo Chlorobi que realizan la fotosíntesis anoxigénica.[1]​ Son fotolitoautótrofas obligadas que usan sulfuro de hidrógeno (H2S) o azufre (S) como donantes de electrones (por comparación, las plantas durante la fotosíntesis usan agua como donante de electrones y producen oxígeno). Las estructuras donde se almacenan los pigmentos fotosintéticos están unidas a la membrana y se conocen como clorosomas o vesículas clorobiales. Estos clorosomas contienen bacterioclorofila "c", "d" y "e".

Estas bacterias se encuentran en las zonas ricas en azufre y anaerobias de los lagos. Algunas de estas bacterias contienen vesículas que les permiten ajustar la profundidad para conseguir una cantidad óptima de luz y H2S ya que estas bacterias son generalmente inmóviles (se conoce una especie que tiene un flagelo). Otras especies no tienen vesículas y se las encuentra en el fango rico en azufre en el fondo de los lagos y lagunas. Estas bacterias son bien diversas morfológicamente y se pueden presentar como bacilos, cocos y vibrios. Algunas crecen solas, otras en cadenas y pueden ser de color verde grama o marrón chocolate.

Una especie de bacteria verde del azufre ha sido encontrada viviendo en una fumarola de la costa de México a una profundidad de 2.500 metros bajo la superficie del Océano Pacífico. A esta profundidad, las bacterias, denominadas GSB1, viven del débil resplandor del respiradero termal puesto que ninguna luz del sol puede penetrar a tal profundidad.[2]

Las bacterias verdes del azufre se clasifican en la familia Chlorobiaceae que, al no estar estrechamente emparentada con ninguna otra, se incluye en su propio filo, Chlorobi. El grupo más próximo es Bacteroidetes.

Referencias[editar]

  1. D.A. Bryant & N.-U. Frigaard (Nov de 2006). «Prokaryotic photosynthesis and phototrophy illuminated». Trends Microbiol. 14 (11): 488. doi:10.1016/j.tim.2006.09.001.
  2. Beatty JT, Overmann J, Lince MT, Manske AK, Lang AS, Blankenship RE, Van Dover CL, Martinson TA, Plumley FG. (2005). «An obligately photosynthetic bacterial anaerobe from a deep-sea hydrothermal vent». Proc. Natl Acad. Sci. USA 102 (26): 9306-10. PMID 15967984. doi:10.1073/pnas.0503674102.

Véase también[editar]

Enlaces externos[editar]

 title=
license
cc-by-sa-3.0
copyright
Autores y editores de Wikipedia
original
visit source
partner site
wikipedia ES

Chlorobia: Brief Summary ( Spanish; Castilian )

provided by wikipedia ES

Las bacterias verdes del azufre o Chlorobia constituyen un pequeño grupo de bacterias del filo Chlorobi que realizan la fotosíntesis anoxigénica.​ Son fotolitoautótrofas obligadas que usan sulfuro de hidrógeno (H2S) o azufre (S) como donantes de electrones (por comparación, las plantas durante la fotosíntesis usan agua como donante de electrones y producen oxígeno). Las estructuras donde se almacenan los pigmentos fotosintéticos están unidas a la membrana y se conocen como clorosomas o vesículas clorobiales. Estos clorosomas contienen bacterioclorofila "c", "d" y "e".

Estas bacterias se encuentran en las zonas ricas en azufre y anaerobias de los lagos. Algunas de estas bacterias contienen vesículas que les permiten ajustar la profundidad para conseguir una cantidad óptima de luz y H2S ya que estas bacterias son generalmente inmóviles (se conoce una especie que tiene un flagelo). Otras especies no tienen vesículas y se las encuentra en el fango rico en azufre en el fondo de los lagos y lagunas. Estas bacterias son bien diversas morfológicamente y se pueden presentar como bacilos, cocos y vibrios. Algunas crecen solas, otras en cadenas y pueden ser de color verde grama o marrón chocolate.

Una especie de bacteria verde del azufre ha sido encontrada viviendo en una fumarola de la costa de México a una profundidad de 2.500 metros bajo la superficie del Océano Pacífico. A esta profundidad, las bacterias, denominadas GSB1, viven del débil resplandor del respiradero termal puesto que ninguna luz del sol puede penetrar a tal profundidad.​

Las bacterias verdes del azufre se clasifican en la familia Chlorobiaceae que, al no estar estrechamente emparentada con ninguna otra, se incluye en su propio filo, Chlorobi. El grupo más próximo es Bacteroidetes.

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Autores y editores de Wikipedia
original
visit source
partner site
wikipedia ES

Chlorobi: Brief Summary ( Italian )

provided by wikipedia IT

I Chlorobi Iino et al., 2010 sono una divisione del regno dei batteri.

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Autori e redattori di Wikipedia
original
visit source
partner site
wikipedia IT

Chlorobium phaeovibrioides: Brief Summary ( Italian )

provided by wikipedia IT

Il Chlorobium phaeovibrioides è un batterio Gram-negativo appartenente alla famiglia dei Chlorobiaceae.

È di color marrone scuro ed è ha forma di virgola.

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Autori e redattori di Wikipedia
original
visit source
partner site
wikipedia IT

Chlorobium: Brief Summary ( Italian )

provided by wikipedia IT
license
cc-by-sa-3.0
copyright
Autori e redattori di Wikipedia
original
visit source
partner site
wikipedia IT

Chlorobia ( Russian )

provided by wikipedia русскую Википедию
Тип: Chlorobi
Класс: Chlorobia Garrity and Holt 2001
Порядок: Chlorobiales Gibbons and Murray 1978
Семейство: Зелёные серобактерии
Международное научное название

Chlorobiaceae Copeland 1956

Роды Wikispecies-logo.svg
Систематика
на Викивидах
Commons-logo.svg
Изображения
на Викискладе
ITIS 956355NCBI 191412EOL 7825

Зелёные серобактерии (лат. Chlorobiaceae) — семейство облигатно анаэробных (более строгих, чем пурпурные бактерии, в присутствии O2 не растут) фотолитоавтотрофных грамотрицательных бактерий, использующих сероводород (H2S), водород (H2) и элементарную серу (S0) в качестве доноров электронов. По происхождению они принадлежат к надтипу Bacteroidetes-Chlorobi, однако неоднородны и потому их классифицируют как отдельный тип[1].

Характеристика

Клетки палочковидные, яйцеобразные, слегка изогнутые, в форме сферы или спиральные. При выращивании в чистой культуре часто образуют цепочки, клубки или сетчатые структуры. В качестве запасного вещества накапливают гликоген. Группа достаточно однородна по нуклеотидному составу ДНК: молярное содержание ГЦ-оснований колеблется от 48 до 58 %[2]. Зелёные серобактерии неподвижны (за исключением Chloroherpeton thalassium, который может передвигаться путём бактериального скольжения)[1], однако обладают газовыми вакуолями. Фотосинтез происходит с использованием бактериохлорофиллов c, d или e, служащих вспомогательными пигментами к бактериохлорофиллу a, а также каротиноидов алициклического типа[3]. Большая часть вспомогательных хлорофиллов, локализована в хлоросомах — покрытых белковой оболочкой органеллах, закреплённых на внутренней стороне цитоплазматической мембраны клетки при помощи базальной пластинки[1]. Основной источник углерода — углекислота. Эти бактерии используют сульфиды, водород или, в редких случаях, ионы железа как доноры электронов; фотосинтез происходит с помощью реакционного центра I типа, сходного по строению с фотосистемой I, и комплекса Фенна-Мэтьюса-Ольсона. В отличие от них, клетки растений в качестве донора электронов используют воду и образуют кислород[1]. Большая часть видов — мезофилы и нейтрофилы, ряд форм относится к галотолерантным[3].

Окисление сульфида, происходящее в периплазматическом пространстве, на первом этапе приводит к образованию молекулярной серы, откладывающейся вне клетки. После исчерпания H2S из среды, S0 поглощается клетками и в периплазматическом пространстве окисляется до сульфата. Изучение локализации процесса образования молекулярной серы у разных групп фототрофных и хемотрофных H2S-окисляющих эубактерий привело к заключению о его однотипности. Во всех случаях сера образуется в клеточном периплазматическом пространстве, но у одних организмов она потом выделяется в среду (зелёные несерные бактерии), у других остаётся в пределах клетки[4].

Местообитание

Виды зелёных серобактерий были найдены в воде около чёрных курильщиков, на территории тихоокеанского побережья Мексики, на глубине до 2500 м. На этой глубине, куда не попадает солнечный свет, бактерии, обозначенные GSB1, живут исключительно за счёт тусклого свечения гидротермального источника[5].

Зелёные серобактерии также обнаружены в Озере Матано, Индонезия, на глубине приблизительно 110—120 метров. Популяция, возможно, содержит виды Chlorobium ferrooxidans[6].

Зелёные серобактерии редко образуют скопления. Они растут в илах в зоне хемоклина под слоем пурпурных бактерий. С глубиной зелёные виды замещаются коричневыми. Для них характерно образование консорциумов на основе синтрофии по сероводороду[7].

Физиология

Способность использования зелёными серобактериями органических соединений ограничена несколькими сахарами, аминокислотами и органическими кислотами. Ни в одном случае органические соединения не могут служить донорами электронов или основным источником углерода. Их использование возможно только при наличии в среде H2S и CO2. Для некоторых зелёных серобактерий показана способность к фиксации N2[4], остальные в качестве источника азота предпочитают ионы аммония[3].

Необычной особенностью группы является доказанное наличие восстановительного цикла трикарбоновых кислот, или цикла Арнона (D. Arnon), вместо обычного цикла Кальвина. В этом цикле углекислый газ фиксируется в ходе ферментативных реакций, две из которых идут при участии фотохимически восстановленного ферредоксина, а одна — таким же путём образованного НАДН. В результате одного оборота цикла из трёх молекул CO2 и 12H+ с использованием энергии пяти молекул АТФ синтезируется молекула триозофосфата. Имеется незамкнутый ЦТК без глиоксилатного шунта. Большинство способны сами синтезировать все необходимые для жизни вещества, но некоторые нуждаются в витамине B12[3].

Зелёные серобактерии способны к аноксигенному фотосинтезу. Из переносчиков электронов у них обнаружены цитохромы с и b, а также менахиноны. Синтез восстановительных эквивалентов осуществляется за счёт электронов окисленной серы, которые поступают в цикл при помощи фермента тиосульфатредуктазы, который окисляет тиосульфат и восстанавливает цитохром с. По отношению к интенсивности света делятся на две группы: первая требует высокой освещённости, а вторая способна существовать на глубинах до 80 м и более при очень слабом освещении[3].

Chlorobium tepidum из этой группы, используется как модельный организм. На данный момент секвенирован геном десяти представителей группы, что вполне достаточно для характеризации биоразнообразия всего семейства. Эти геномы имеют размеры в 2—3 Mbp и кодируют 1750—2800 генов, 1400—1500 из которых общие для всех штаммов. У этих бактерий отсутствуют двухкомпонентные гистидин-киназы и регуляторные гены, что предполагает ограниченную фенотипическую пластичность и неспособность быстро приспосабливаться к меняющимся условиям среды. Незначительная зависимость этих бактерий от белков-транспортёров органических веществ и факторов транскрипции также указывает на адаптированность этих организмов к узкой экологической нише с ограниченными источниками энергии, подобно цианобактериям Prochlorococcus и Synechococcus[1].

Филогения

Данное таксономическое дерево основано на List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LSPN)[8][9], филогения основана на анализе 16S рРНК из выпуска № 106[10].

Таксономическое дерево

Ignavibacteriaceae

Ignavibacterium album Iino et al. 2010



Melioribacter roseusPodosokorskaya et al. 2011



Chlorobiaceae

?Ancalochloris perfilieviiGorlenko and Lebedeva 1971



?Clathrochloris sulfuricaWitt et al. 1989



?Pelodictyon phaeum Gorlenko 1972



Chloroherpeton thalassium Gibson et al. 1985



Prosthecochloris

?P. aphaeoasteroides



?P. indicaAnil 2005



P. aestuarii Gorlenko 1970 emend. Imhoff 2003 (type sp.)



P. vibrioformis (Pelsh 1936) Imhoff 2003






Chlorobium chlorovibrioides(Gorlenko et al. 1974) Imhoff 2003


Chlorobaculum

?C. limnaeum Imhoff 2003



?C. macestaeKeppen et al. 2008



?C. parvum Imhoff 2003



C. tepidum (Wahlund et al. 1996) Imhoff 2003 (type sp.)



C. thiosulfatiphilum Imhoff 2003




Chlorobium

?C. bathyomarinumBeatty et al. 2005



?C. chlorochromatiiVogl et al. 2006 (epibiont of the phototrophic consortium Chlorochromatium aggregatum)



?C. gokarnaAnil 2005



?C. ferrooxidans Heising et al. 1998 emend. Imhoff 2003



C. luteolum (Schmidle 1901) emend. Imhoff 2003




C. phaeovibrioides Pfennig 1968 emend. Imhoff 2003




C. limicola Nadson 1906 emend. Imhoff 2003 (type sp.)




C. clathratiforme (Szafer 1911) emend. Imhoff 2003



C. phaeobacteroides Pfennig 1968 emend. Imhoff 2003










Примечания:
♪ Прокариоты, которых нельзя выделить в чистую культуру, то есть не культивируются или культура не живёт дольше нескольких циклов пересеивания
♥ Таксоны, которых нет в National Center for Biotechnology Information (NCBI), но которые числятся в List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)
♠ Таксоны, найденные в National Center for Biotechnology Information (NCBI), но отсутствующие в списке List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LSPN).

Примечания

  1. 1 2 3 4 5 Bryant D. A. & Frigaard N.-U. (Nov 2006). “Prokaryotic photosynthesis and phototrophy illuminated”. Trends Microbiol. 14 (11): 488. DOI:10.1016/j.tim.2006.09.001. Используется устаревший параметр |month= (справка)
  2. Гусев, Минеева, 2003, с. 298.
  3. 1 2 3 4 5 Нетрусов, Котова, 2012, с. 190.
  4. 1 2 Гусев, Минеева, 2003, с. 303.
  5. Beatty JT, Overmann J, Lince MT, Manske AK, Lang AS, Blankenship RE, Van Dover CL, Martinson TA, Plumley FG. (2005). “An obligately photosynthetic bacterial anaerobe from a deep-sea hydrothermal vent”. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 102 (26): 9306–10. PMID 15967984.
  6. Crowe Sean, Jones CarriAyne, Katsev Sergei et al. C. (2008). “Photoferrotrophs thrive in an Archean Ocean analogue”. Proceedings of the National Academy of Sciences. 105 (41): 15938—43. DOI:10.1073/pnas.0805313105. ISSN 0148-0227. PMC 2572968. PMID 18838679.
  7. Нетрусов, Котова, 2012, с. 209.
  8. См. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature. Информация взята с сайта J.P. Euzéby. Chlorobi (неопр.). Проверено 17 ноября 2011. Архивировано 11 августа 2012 года.
  9. См. NCBI страница Chlorobi Информация взята с сайта Sayers et al. NCBI Taxonomy Browser (неопр.). National Center for Biotechnology Information. Проверено 5 июня 2011.
  10. См. The All-Species Living Tree Project (англ.)русск. [1]. Информация взята с сайта 16S rRNA-based LTP release 106 (full tree) (неопр.). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database (англ.)русск.. Проверено 17 ноября 2011. Архивировано 11 августа 2012 года.
license
cc-by-sa-3.0
copyright
Авторы и редакторы Википедии

Chlorobia: Brief Summary ( Russian )

provided by wikipedia русскую Википедию

Зелёные серобактерии (лат. Chlorobiaceae) — семейство облигатно анаэробных (более строгих, чем пурпурные бактерии, в присутствии O2 не растут) фотолитоавтотрофных грамотрицательных бактерий, использующих сероводород (H2S), водород (H2) и элементарную серу (S0) в качестве доноров электронов. По происхождению они принадлежат к надтипу Bacteroidetes-Chlorobi, однако неоднородны и потому их классифицируют как отдельный тип.

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Авторы и редакторы Википедии