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Guttavirus ( Catalan; Valencian )

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Guttavirus és un gènere de virus d'ADN bicatenari que infecten el gènere Sulfolobus dels organismes Archaea. Espècie tipus: Sulfolobus virus SNDV.

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Guttavirus: Brief Summary ( Catalan; Valencian )

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Guttavirus és un gènere de virus d'ADN bicatenari que infecten el gènere Sulfolobus dels organismes Archaea. Espècie tipus: Sulfolobus virus SNDV.

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Guttaviridae ( German )

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Guttaviridae Systematik Klassifikation: Viren Ordnung: nicht klassifiziert Familie: Guttaviridae Taxonomische Merkmale Genom: dsDNA zirkulär Baltimore: Gruppe 1 Symmetrie: komplex Hülle: vorhanden Wissenschaftlicher Name Guttaviridae (engl.)

Die Virusfamilie Guttaviridae mit ihrer ursprünglich einzigen Gattung Guttavirus wurden neu geschaffen, als eine neue Bakteriophagenspezies bei der Untersuchung extrachromosomalen, genetischen Materials in verschiedenen Stämmen der Archaeengattung Sulfolobus (Crenarchaeota) isoliert und charakterisiert wurde. Bei einem Stamm (Sulfolobus STH3/1, Sulfolobus neozealandicus) dieser extrem thermophilen und acidophilen Archaebakterien, der aus einem Fumarolenfeld südlich des Lake Taupo (Neuseeland) stammte, wurden Viren mit einer tropfenförmigen Gestalt (lat. gutta: Tropfen) beobachtet. Die neue Virusspezies wurde als Sulfolobus neozealandicus drop-shaped virus (SNDV) bezeichnet. Inzwischen (Stand November 2018) hat das ICTV diese Gattung aufgespaltet in zwei Gattungen Alphaguttavirus (einzige Spezies: SNDV) und Betaguttavirus (einzige Spezies Aeropyrum pernix ovoid virus 1, APOV1).[1]

Die Virionen (Viruspartikel) Guttaviridae sind behüllte, unregelmäßige, überwiegend ovoid (ei- oder tropfenförmig) geformte Kapside. Diese weißen (zumindest) beim SNDV an ihrem spitzen Ende mehrere dünne Filamente auf. Die Funktion dieser Filamente ist unbekannt. Die Symmetrie des Kapsids ist ebenfalls unklar, im Elektronenmikroskop erscheinen gestapelte, helikale Strukturen. Die Virionen sind 110 bis 185 nm lang und maximal 70 bis 95 nm breit. Ein Hauptstrukturprotein (17,5 kDa) und zwei kleinere Strukturproteine (13,5 und 13 kDa) sind im Virion nachweisbar.

Das Genom des SNDV besteht aus einer zirkulär geschlossenen, doppelsträngigen DNA (cccDNA) und ist etwa 20 kBp lang. Das Genom ist zusätzlich an sehr vielen Stellen methyliert. Aufgrund der speziellen, nicht bei dem Wirt vorkommenden N(6)-Methylierung wird angenommen, dass das SNDV über eine eigene DNA-Methyltransferase verfügt. Die virale DNA ist daher mit den meisten Restriktionsendonukleasen nicht spaltbar, lediglich das dam-Methylierung-abhängige Restriktionsenzym DpnI ist in der Lage, SNDV-DNA zu schneiden.

Quellen

  • W. Zillig et al.: Viruses, plasmids and other genetic elements of thermophilic and hyperthermophilic Archaea. FEMS Microbiol Rev. (1996) 18(2-3): S. 225–236 (Review), PMID 8639330
  • H. P. Arnold et al.: SNDV, a novel virus of the extremely thermophilic and acidophilic archaeon Sulfolobus. Virology (2000) 272(2): S. 409–416, PMID 10873785 (Volltext)
  • G. Lipps: Plasmids and viruses of the thermoacidophilic crenarchaeote Sulfolobus. Extremophiles (2006) 10(1): S. 17–28, PMID 16397749

Einzelnachweise

  1. ICTV: Master Species List 2018a v1, MSL including all taxa updates since the 2017 release. Fall 2018 (MSL #33)
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Guttaviridae: Brief Summary ( German )

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Die Virusfamilie Guttaviridae mit ihrer ursprünglich einzigen Gattung Guttavirus wurden neu geschaffen, als eine neue Bakteriophagenspezies bei der Untersuchung extrachromosomalen, genetischen Materials in verschiedenen Stämmen der Archaeengattung Sulfolobus (Crenarchaeota) isoliert und charakterisiert wurde. Bei einem Stamm (Sulfolobus STH3/1, Sulfolobus neozealandicus) dieser extrem thermophilen und acidophilen Archaebakterien, der aus einem Fumarolenfeld südlich des Lake Taupo (Neuseeland) stammte, wurden Viren mit einer tropfenförmigen Gestalt (lat. gutta: Tropfen) beobachtet. Die neue Virusspezies wurde als Sulfolobus neozealandicus drop-shaped virus (SNDV) bezeichnet. Inzwischen (Stand November 2018) hat das ICTV diese Gattung aufgespaltet in zwei Gattungen Alphaguttavirus (einzige Spezies: SNDV) und Betaguttavirus (einzige Spezies Aeropyrum pernix ovoid virus 1, APOV1).

Die Virionen (Viruspartikel) Guttaviridae sind behüllte, unregelmäßige, überwiegend ovoid (ei- oder tropfenförmig) geformte Kapside. Diese weißen (zumindest) beim SNDV an ihrem spitzen Ende mehrere dünne Filamente auf. Die Funktion dieser Filamente ist unbekannt. Die Symmetrie des Kapsids ist ebenfalls unklar, im Elektronenmikroskop erscheinen gestapelte, helikale Strukturen. Die Virionen sind 110 bis 185 nm lang und maximal 70 bis 95 nm breit. Ein Hauptstrukturprotein (17,5 kDa) und zwei kleinere Strukturproteine (13,5 und 13 kDa) sind im Virion nachweisbar.

Das Genom des SNDV besteht aus einer zirkulär geschlossenen, doppelsträngigen DNA (cccDNA) und ist etwa 20 kBp lang. Das Genom ist zusätzlich an sehr vielen Stellen methyliert. Aufgrund der speziellen, nicht bei dem Wirt vorkommenden N(6)-Methylierung wird angenommen, dass das SNDV über eine eigene DNA-Methyltransferase verfügt. Die virale DNA ist daher mit den meisten Restriktionsendonukleasen nicht spaltbar, lediglich das dam-Methylierung-abhängige Restriktionsenzym DpnI ist in der Lage, SNDV-DNA zu schneiden.

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Guttaviridae

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Guttaviridae is a family of viruses. Sulfolobus newzealandicus serve as natural hosts. There are currently only two species in this family, divided among 2 genera.[1][2] The name is derived from the Latin gutta, meaning 'droplet'.[3][4][5]

Taxonomy

Group: dsDNA

[2]

Structure

Viruses in the family Guttaviridae are enveloped. The diameter is around 70–95 nm, with a length of 110–185 nm. Genomes are circular, around 20kb in length.[2][3] The virons consist of a coat, a core, a nucleocapsid, and projecting fibers at the pointed end. The surface of the virion has a beehive-like ribbed surface pattern with protrusions that are densely covered by a 'beard' of long fibers at its pointed end. The genome is extremely heavily methylated.

Life cycle

DNA-templated transcription is the method of transcription. Sulfolobus newzealandicus serve as the natural host.[2][3]

References

  1. ^ Prangishvili, D; Mochizuki, T; Krupovic, M; ICTV Report Consortium (8 February 2018). "ICTV Virus Taxonomy Profile: Guttaviridae". The Journal of General Virology. doi:10.1099/jgv.0.001027. PMC 5882108. PMID 29458561.
  2. ^ a b c d "ICTV Online Report Guttaviridae".
  3. ^ a b c "Viral Zone". ExPASy. Archived from the original on 17 June 2015. Retrieved 15 June 2015.
  4. ^ Mochizuki T, Sako Y, Prangishvili D (2011) Provirus induction in hyperthermophilic Archaea: Characterization of Aeropyrum pernix spindle-shaped virus 1 and Aeropyrum pernix ovoid virus 1. J Bacteriol 193(19):5412–5419
  5. ^ Arnold HP, Ziese U and Zillig W (2000). SNDV, a novel virus of the extremely thermophilic and acidophilic archaeon Sulfolobus. Virology 272:409–16.

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Guttaviridae: Brief Summary

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Guttaviridae is a family of viruses. Sulfolobus newzealandicus serve as natural hosts. There are currently only two species in this family, divided among 2 genera. The name is derived from the Latin gutta, meaning 'droplet'.

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Guttaviridae ( Spanish; Castilian )

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Guttaviridae es una familia de virus. Actualmente sólo hay dos especies en esta familia, divididas en 2 géneros.[1][2]​ El nombre se deriva del latín gutta, que significa "gota".[3][4][5]​. Infecta a la arquea Sulfolobus. Tiene un genoma ADN bicatenario y por lo tanto pertenece al Grupo I de la Clasificación de Baltimore. La especie tipo es Sulfolobus virus SNDV.

Estructura

Los virus de la familia Guttaviridae están envueltos. El diámetro es de alrededor de 70-95 nm, con una longitud de 110-185 nm. Los genomas son circulares, alrededor de 20kb de longitud.[2][3]​ Los virones consisten en una capa, un núcleo, una nucleocápside, y fibras salientes en el extremo puntiagudo. La superficie del virión tiene un patrón de superficie acanalado como una colmena con protuberancias que están densamente cubiertas por una "barba" de fibras largas en su extremo puntiagudo. El genoma está extremadamente fuertemente metilado.

Ciclo de vida

La transcripción con ADN es el método de transcripción. Sulfolobus newzealandicus sirve como el anfitrión natural.[2][3]

Referencias

  1. Prangishvili, D; Mochizuki, T; Krupovic, M; ICTV Report Consortium (8 de febrero de 2018). «ICTV Virus Taxonomy Profile: Guttaviridae.». The Journal of General Virology. PMC 5882108. PMID 29458561. doi:10.1099/jgv.0.001027.
  2. a b c «ICTV Online Report Guttaviridae».
  3. a b c «Viral Zone». ExPASy. Archivado desde el original el 17 de junio de 2015. Consultado el 15 de junio de 2015. |archive-url= y |urlarchivo= redundantes (ayuda); |archive-date= y |fechaarchivo= redundantes (ayuda)
  4. Mochizuki T, Sako Y, Prangishvili D (2011) Provirus induction in hyperthermophilic Archaea: Characterization of Aeropyrum pernix spindle-shaped virus 1 and Aeropyrum pernix ovoid virus 1. J Bacteriol 193(19):5412–5419
  5. Arnold HP, Ziese U and Zillig W (2000). SNDV, a novel virus of the extremely thermophilic and acidophilic archaeon Sulfolobus. Virology 272:409–16.

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Guttaviridae: Brief Summary ( Spanish; Castilian )

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Guttaviridae es una familia de virus. Actualmente sólo hay dos especies en esta familia, divididas en 2 géneros.​​ El nombre se deriva del latín gutta, que significa "gota".​​​. Infecta a la arquea Sulfolobus. Tiene un genoma ADN bicatenario y por lo tanto pertenece al Grupo I de la Clasificación de Baltimore. La especie tipo es Sulfolobus virus SNDV.

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滴狀病毒科 ( Chinese )

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滴狀病毒科 病毒分类 族: 族 I (dsDNA) 分類
  • 滴狀病毒屬(Guttavirus; Sulfolobus SNDV- like viruses)-代表種:紐西蘭島硫化裂葉菌滴狀病毒(Sulfolobus neozealandicus droplet-shaped virus; Sulfolobus virus SNDV)
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滴狀病毒科: Brief Summary ( Chinese )

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