Els corarqueots (Korarchaeota) són un filum d'arqueobacteris.[1]
Els korarqueots són un grup d'arqueobacteris coneguts únicament a partir de seqüències d'ARNr 16S obtingudes de mostres de medis hidrotèrmics a temperatures elevades. Les anàlisis de les seves seqüències de gens 16S suggereixen que no formen part dels grups principals d'arqueobacteris, els crenarqueots i euriarqueots. Tanmateix, és possible que els korarqueots no formin en realitat un grup separat, sinó que simplement siguin organismes en què els gens d'ARNr 16S han sofert mutacions ràpides o inusuals. Els processos metabòlics dels korarqueots, incloent-hi la manera en què generen energia i obtenen carbon, són actualment desconeguts. Recentment s'ha seqüenciat el genoma d'un korarqueot que fou enriquit d'un cultiu mixt.[2]
Els corarqueots (Korarchaeota) són un filum d'arqueobacteris.
Els korarqueots són un grup d'arqueobacteris coneguts únicament a partir de seqüències d'ARNr 16S obtingudes de mostres de medis hidrotèrmics a temperatures elevades. Les anàlisis de les seves seqüències de gens 16S suggereixen que no formen part dels grups principals d'arqueobacteris, els crenarqueots i euriarqueots. Tanmateix, és possible que els korarqueots no formin en realitat un grup separat, sinó que simplement siguin organismes en què els gens d'ARNr 16S han sofert mutacions ràpides o inusuals. Els processos metabòlics dels korarqueots, incloent-hi la manera en què generen energia i obtenen carbon, són actualment desconeguts. Recentment s'ha seqüenciat el genoma d'un korarqueot que fou enriquit d'un cultiu mixt.
Korarchaeota je navrhovaný kmen v rámci domény archea. Jeho existence je založena pouze na sekvenaci DNA ze vzorků vody v okolí horkých vřídel (např. v okolí Yellowstone National Park).[1] Právě sekvenace genu pro 16S rRNA (malou ribozomální podjednotku) ukazuje, že korarchaeota jsou nezávislou evoluční větví, ačkoliv se také spekuluje, že u nich proběhla jen rychlá evoluce tohoto genu a výsledky jsou tím zkreslené. Sekvenace DNA korarchea z druhu Candidatus Korarchaeum cryptofilum ukazuje, že korarchaeota jsou velmi starou skupinou v rámci archeí, která je možná příbuzná kmeni crenarchaeota, ačkoliv některé znaky ukazují na příbuznost s euryarchaeota.[2]
V tomto článku byl použit překlad textu z článku Korarchaeota na anglické Wikipedii.
Korarchaeota je navrhovaný kmen v rámci domény archea. Jeho existence je založena pouze na sekvenaci DNA ze vzorků vody v okolí horkých vřídel (např. v okolí Yellowstone National Park). Právě sekvenace genu pro 16S rRNA (malou ribozomální podjednotku) ukazuje, že korarchaeota jsou nezávislou evoluční větví, ačkoliv se také spekuluje, že u nich proběhla jen rychlá evoluce tohoto genu a výsledky jsou tím zkreslené. Sekvenace DNA korarchea z druhu Candidatus Korarchaeum cryptofilum ukazuje, že korarchaeota jsou velmi starou skupinou v rámci archeí, která je možná příbuzná kmeni crenarchaeota, ačkoliv některé znaky ukazují na příbuznost s euryarchaeota.
Корархеоти були знайдені тільки в гідротермальних джерелах з високою температурою. У різних особин є відмінності на різному філогенетичному рівні, пов'язані з умовами, в яких вони мешкають: температурою, солоністю води (прісна або морська) та/або географією місця[5]. У природі Корархеоти були виявлені лише в невеликих кількостях[5][6][7].
Корархеоти були знайдені тільки в гідротермальних джерелах з високою температурою. У різних особин є відмінності на різному філогенетичному рівні, пов'язані з умовами, в яких вони мешкають: температурою, солоністю води (прісна або морська) та/або географією місця. У природі Корархеоти були виявлені лише в невеликих кількостях.
Korarchaeota Barns et al. 1996
СинонимыКорархеоты[2] (лат. Korarchaeota) — тип архей[3].
Анализ последовательности генов их 16s рРНК показал, что корархеоты давно отделились от остальных архей и не принадлежат к их главным группам, кренархеотам (Crenarchaeota) и эвриархеотам (Euryarchaeota)[4]. Анализ генома одного из корархеот, выращенного в смешанной культуре, выявил ряд сближающих с кренархеотами и эвриархеотами черт, тем самым подтвердив гипотезу о существовании древнего общего предка этих групп[5].
Корархеоты были найдены только в гидротермальных источниках с высокой температурой. У разных особей имеются различия на разном филогенетическом уровне, связанные с условиями, в которых они обитают: температурой, солёностью воды (пресная или морская) и/или географией места[6]. В природе корархеоты были обнаружены лишь небольших количествах[6][7][8].
На июнь 2017 года в таксон включают всего 1 описанный род и вид[3], который пока не удалось культивировать в чистой культуре[2]:
В окружающей среде найдено несколько геномов, относящихся к типу, но не к указанным выше роду и виду.
|month=
(справка) |month=
(справка) Корархеоты (лат. Korarchaeota) — тип архей.
В каждом из этих камчатских горячих источников были обнаружены корархеотыАнализ последовательности генов их 16s рРНК показал, что корархеоты давно отделились от остальных архей и не принадлежат к их главным группам, кренархеотам (Crenarchaeota) и эвриархеотам (Euryarchaeota). Анализ генома одного из корархеот, выращенного в смешанной культуре, выявил ряд сближающих с кренархеотами и эвриархеотами черт, тем самым подтвердив гипотезу о существовании древнего общего предка этих групп.
初古菌門(学名:Korarchaeota),名称来自希腊语中的名词“koros”或“kore”,意思是“年轻男子”或“年轻女子”,以及“古老的”“archaios”,中文译为“初古菌”。初古菌門是通過16S rRNA序列區分開的一類古菌,來源於美國黃石公園超熱環境中的樣品。通過熒光原位雜交能夠確認它們的存在。但目前還沒有能夠成功培養的樣品,與其他生物的關係也尚未確定。它們有可能並不是一個獨立的類群,而是16S rRNA發生了某些快速或特殊突變的種類。
初古菌門(学名:Korarchaeota),名称来自希腊语中的名词“koros”或“kore”,意思是“年轻男子”或“年轻女子”,以及“古老的”“archaios”,中文译为“初古菌”。初古菌門是通過16S rRNA序列區分開的一類古菌,來源於美國黃石公園超熱環境中的樣品。通過熒光原位雜交能夠確認它們的存在。但目前還沒有能夠成功培養的樣品,與其他生物的關係也尚未確定。它們有可能並不是一個獨立的類群,而是16S rRNA發生了某些快速或特殊突變的種類。
コルアーキオータ門(界)(Korarchaeota、Korarchaea、コル古細菌)とは1996年にBarnsらによって指摘された古細菌、第三番目の門(界)。
アメリカアイダホ州のイエローストーン国立公園の74-93°Cの熱水底泥にPCR法を用いて、16S rRNA系統解析を試みたところ、クレンアーキオータ、ユリアーキオータ界のどちらにも入らない配列を発見した。この結果より、Barnsらは、従来のWoeseによる『古細菌は二界である』という説を覆し『古細菌は三界よりなる』という主張を打ち立てた。
発見から十年以上が経過しているがいまだ実態は不明な点が多い。1997年にFISH法を用いて増殖していることが確認されているが、これまでに純粋培養は成功していない。しかしながら2008年に“Candidatus Korarchaeum cryptofilum”と呼ばれる株について、全ゲノムの解読が報告された。生命の起源に最も近い生物とも、クレンアーキオータにやや近縁とも言われている。
Korarchaeota(コルアーキオータ)のkorosあるいはkoreとは若い男、あるいは女という意味。
コルアーキオータ門(界)(Korarchaeota、Korarchaea、コル古細菌)とは1996年にBarnsらによって指摘された古細菌、第三番目の門(界)。
アメリカアイダホ州のイエローストーン国立公園の74-93°Cの熱水底泥にPCR法を用いて、16S rRNA系統解析を試みたところ、クレンアーキオータ、ユリアーキオータ界のどちらにも入らない配列を発見した。この結果より、Barnsらは、従来のWoeseによる『古細菌は二界である』という説を覆し『古細菌は三界よりなる』という主張を打ち立てた。
発見から十年以上が経過しているがいまだ実態は不明な点が多い。1997年にFISH法を用いて増殖していることが確認されているが、これまでに純粋培養は成功していない。しかしながら2008年に“Candidatus Korarchaeum cryptofilum”と呼ばれる株について、全ゲノムの解読が報告された。生命の起源に最も近い生物とも、クレンアーキオータにやや近縁とも言われている。