Partitiviridae és una família de virus de les plantes i els fongs que és del tipus d’ARN bicatenari. Rep el nom del llatí partitius, que significa “dividit”, ja que tenen genomes segmentats.
Partitiviruses principalment infecta fongs i en canvi Alphacryptoviruses i Betacryptoviruses infecten plantes. Són bastant específics pel que fa als seus hostes i en les plantes es transmeten generalment per les llavors. Fins recentment es considerava que la família Chrysoviridae també formava part del partitivirus
Partitiviridae és una família de virus de les plantes i els fongs que és del tipus d’ARN bicatenari. Rep el nom del llatí partitius, que significa “dividit”, ja que tenen genomes segmentats.
Partitiviridae is a family of double-stranded RNA viruses.[2] Plants, fungi, and protozoa serve as natural hosts. It has been suggested that they can also infect bacteria.[3] The name comes from the Latin partitius, which means divided, and refers to the segmented genome of partitiviruses. There are five genera and 60 species in the family, 15 of which are unassigned to a genus.[4][5]
Viruses in the family Partitiviridae are non-enveloped with icosahedral geometries and T=1 symmetry.[6] The diameter of partitiviruses is around 25–43 nm.[4]
Partitiviruses have double-stranded RNA genomes divided into two genomic segments, and there may be additional subgenomic segments. The two genome segments are packaged in separate virus particles. They code for two separate proteins. The first segment codes for the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp), and the second segment codes for the coat protein. The segments are around 1.4–3.0 kbp in length, while the total genome length is around 3.0–4.8 kbp.[4][6]
Viral replication is cytoplasmic. Entry into the host cell is achieved by penetration into the host cell. Replication follows the double-stranded RNA virus replication model. Double-stranded RNA virus transcription is the method of transcription. The virus exits the host cell by cell-to-cell movement. Fungi and plants serve as the natural host.[4][6] Cryspoviruses infect apicomplexian protozoa of the genus Cryptosporidium,[7] while viruses of the other genera infect plants and fungi. It has been suggested that they can also infect bacteria.
Based on the RNA polymerase gene this group can be divided into four clades (I-IV).[8] Four isolates from animals and protozoans form a fifth clade. Clades I–IV consist of mixtures of partitivirus-like sequences from plants and fungi.
There are five recognized genera within the Partitiviridae family. There are an additional fifteen species in the family unassigned to a genus:[4][5]
Unassigned to a genus:
Partitiviridae is a family of double-stranded RNA viruses. Plants, fungi, and protozoa serve as natural hosts. It has been suggested that they can also infect bacteria. The name comes from the Latin partitius, which means divided, and refers to the segmented genome of partitiviruses. There are five genera and 60 species in the family, 15 of which are unassigned to a genus.
Partitiviridae es una familia de virus que infectan a plantas, hongos, protistas y bacterias.[1] Tienen un genoma ARN de doble cadena y por lo tanto se incluyen en el Grupo III de la Clasificación de Baltimore. El nombre procede de la palabra latina partitius que significa dividido y que hace referencia a su genoma segmentado.
La familia comprende actualmente cinco géneros:[2]
Los partitivirus tienen viriones con geometrías icosaédricas y simetría T=1. No poseen envoltura vírica. El diámetro de los partitivirus es de alrededor de 25 a 43 nm. Los genomas son de ARN bicatenario divididos en dos segmentos, aunque puede haber segmentos subgenómicos adicionales. Los segmentos son encapsulados en la misma partícula de virus, codificando los segmentos más largos una ARN polimerasa dependiente de ARN y los más cortos la proteína de la cápside. Los segmentos tienen una longitud de alrededor de 1,4 a 3,0 kpb y la longitud total del genoma es de 3.000-10.000 nucleótidos.[2][3]
La replicación viral se produce en el citoplasma. La entrada en la célula huésped se logra mediante la penetración en la célula huésped. La replicación sigue el modelo de replicación de virus de ARN de doble cadena. La transcripción de virus de ARN de doble cadena es el método de transcripción. El virus sale de la célula huésped mediante el movimiento de célula a célula.[2][3] Las plantas, protistas, hongos y bacterias sirven como huéspedes naturales.[1]
Según el gen de la ARN polimerasa, este grupo se puede dividir en cuatro clados (I-IV).[2][3]
Los virus que afectan a las plantas son generalmente transmitidos por las semillas, mientras que en el caso de los Partitivirus fungales lo son solo por transmisión vertical o por anastomosis hifal. Hasta recientemente se incluía un cuarto género en la familia, Chrysovirus, que infecta a hongos tales como Penicillium, pero ahora se clasifica en su propia familia, Chrysoviridae, que incluye el Virus de Penicillium chrysogenum.[2][3]
Partitiviridae es una familia de virus que infectan a plantas, hongos, protistas y bacterias. Tienen un genoma ARN de doble cadena y por lo tanto se incluyen en el Grupo III de la Clasificación de Baltimore. El nombre procede de la palabra latina partitius que significa dividido y que hace referencia a su genoma segmentado.
Les Partitiviridae sont une famille de virus de l'ordre des Durnavirales, qui comprend cinq genres et 60 espèces (dont 15 non assignées à un genre) acceptés par l'ICTV. Ce sont des virus à ARN à double brin[3] classés dans le groupe III de la classification Baltimore. Les hôtes naturels de ces virus sont des espèces de champignons, de plantes et de protozoaires. Le nom « Partitiviridae » dérive du latin « partitius », qui signifie « divisé », en référence au génome segmenté des Partitivirus. La famille comprend 60 espèces qui sont rattachées à cinq genres ou pour certaines non attribuées à un genre[4],[5],[6].
Les virus de la famille des Partitiviridae, qu'ils infectent des champignons (virus fongiques) ou des plantes (virus végétaux), sont tous associés à des infections latentes de leurs hôtes respectifs, c'est-à-dire sans symptômes apparents. On ne connaît aucun vecteur biologique naturel de ces virus[7].
Les virus fongiques sont transmis par voie intracellulaire lors de la division cellulaire et la sporogenèse (transmission verticale) ainsi qu'après une anastomose hyphale, c'est-à-dire une fusion cellulaire, entre des souches fongiques compatibles (transmission horizontale). Les virus végétaux ne sont pas transmis horizontalement par greffage ou par d'autres moyens mécaniques, mais sont seulement transmis par les ovules ou le pollen à l'embryon de la graine (transmission verticale)[7].
Les virus de la famille des Partitiviridae sont des virus nus ( non enveloppés) à géométrie icosaédrique de type T = 1. Le diamètre est d'environ 35 à 40 nm[4],[5].
Les Partitivirus ont des génomes à ARN bicaténaire (double brin) divisés en deux segments génomiques essentiels, ARNbc1 et ARNbc2, contenant chacun un gros cadre de lecture ouvert (ORF) sur le brin positif de la molécule d'ARN. Des segments d'ARNbc supplémentaires (satellites ou défectueux) peuvent également être présents. Les segments linéaires d'ARNbc sont encapsidés séparément. Le plus petit des deux segments du génome code généralement la protéine d'enveloppe (CP). Le plus gros segment code l'ARN polymérase ARN-dépendante (RdRp) associée au virion. Les génomes sont linéaires et mesurent environ 1,4 à 3,0 kb[4],[5].
La réplication virale est cytoplasmique. L'entrée dans la cellule-hôte est obtenue par pénétration dans la cellule-hôte. La réplication et la transcription suivent le modèle des virus à ARN double brin. Le virus quitte la cellule hôte par un déplacement de cellule à cellule. Les champignons et les plantes servent d'hôtes naturels[4],[5]. Les Cryspovirus infectent des protozoaires apicomplexiens du genre Cryptosporidium[8], tandis que les virus des autres genres infectent des plantes et des champignons.
Sur la base du gène de l'ARN polymérase, ce groupe peut être divisé en quatre clades (I-IV)[9]. Quatre isolats d'animaux et de protozoaires forment un cinquième clade. Les clades I à IV sont constitués de mélanges de séquences de type Partitivirus provenant de plantes et de champignons
Cinq genres ont été reconnus au sein de la famille des Partitiviridae. Quinze autres espèces de cette famille ne sont affectées à aucun genre[4] :
Les Partitiviridae sont une famille de virus de l'ordre des Durnavirales, qui comprend cinq genres et 60 espèces (dont 15 non assignées à un genre) acceptés par l'ICTV. Ce sont des virus à ARN à double brin classés dans le groupe III de la classification Baltimore. Les hôtes naturels de ces virus sont des espèces de champignons, de plantes et de protozoaires. Le nom « Partitiviridae » dérive du latin « partitius », qui signifie « divisé », en référence au génome segmenté des Partitivirus. La famille comprend 60 espèces qui sont rattachées à cinq genres ou pour certaines non attribuées à un genre,,.
Les virus de la famille des Partitiviridae, qu'ils infectent des champignons (virus fongiques) ou des plantes (virus végétaux), sont tous associés à des infections latentes de leurs hôtes respectifs, c'est-à-dire sans symptômes apparents. On ne connaît aucun vecteur biologique naturel de ces virus.
Les virus fongiques sont transmis par voie intracellulaire lors de la division cellulaire et la sporogenèse (transmission verticale) ainsi qu'après une anastomose hyphale, c'est-à-dire une fusion cellulaire, entre des souches fongiques compatibles (transmission horizontale). Les virus végétaux ne sont pas transmis horizontalement par greffage ou par d'autres moyens mécaniques, mais sont seulement transmis par les ovules ou le pollen à l'embryon de la graine (transmission verticale).
分體病毒科(Partitiviridae)
分體病毒屬(Partitivirus) α隱藏病毒屬(Alphacryptovirus) β隱藏病毒屬(Betacryptovirus)