Spesies ini sering terlihat di perairan laut dekat dengan pantai, beberapa kilometer dari daratan; serta ditemukan di sekitar karang dan terumbu karang berbatu yang merupakan daerah produktif karena adanya proses upwelling yang terus terjadi, gugusan pulau tropis, atol dan teluk. (Ref. 82755). Ikan ini terdapat di perairan beriklim tropis dan beriklim sedang, spesies ikan pari manta ini memiliki distribusi yang luas. Ikan pari manta raksasa terdapat di sepanjang utara dan selatan California dan New Jersey di Amerika Serikat barat dan pantai timur, meliputi Mutsu Bay, Aomori, Jepang, Semenanjung Sinai, Mesir dan Kepulauan Azores di belahan bumi utara dan sepanjang selatan Peru, Uruguay, Afrika Selatan dan Selandia baru di belahan bumi selatan. Ikan pari ini juga daat dijumpai di Samudera Atlantic dari pertengahan antara Brazil dan Carolina, jarang terdapat di perairan Inggris tepi Georges, Bermuda; Madeira; Afrika Barat.